#study=GSE58994 #virus=Human immunodeficiency virus 1 #cell type=peripheral blood mononuclear cell (BTO:0001025) #platform=HuGene-2_0-st probeset Ensembl ID Gene Symbol Uninfected mean Uninfected SD Uninfected count Infected mean Infected SD Infected count log FC fold change raw p-val adjusted p-val ENSG00000033627_at ENSG00000033627 ATP6V0A1 8.022316666666667 0.3794519269507887 6 6.928421666666666 0.26421149266575583 6 -1.0938950000000007 0.46849481946107313 0.0002694955946741378 0.009317892460632807 ENSG00000064666_at ENSG00000064666 CNN2 10.411408333333334 0.20581511046729914 6 9.239525 0.24605649121695614 6 -1.1718833333333336 0.4438415593948466 5.39192183875483e-06 0.0008980192960467357 ENSG00000081041_at ENSG00000081041 CXCL2 9.323403333333333 0.3393674794476727 6 8.089283333333334 0.3553861029734659 6 -1.234119999999999 0.42510171959451276 0.00010904493032939422 0.005583220825630652 ENSG00000099985_at ENSG00000099985 OSM 7.435896666666667 0.4500242865298124 6 6.394263333333334 0.16906685466603635 6 -1.0416333333333334 0.485777194283561 0.0014951512181888556 0.028502371260097376 ENSG00000101265_at ENSG00000101265 RASSF2 10.751595 0.30884624386577897 6 9.515966666666666 0.3161662106972642 6 -1.2356283333333344 0.4246575092738508 4.4819036034538443e-05 0.0032171230316397426 ENSG00000101842_at ENSG00000101842 VSIG1 8.142023333333334 0.37273745986507284 6 6.310643333333334 0.29410490303064757 6 -1.8313800000000002 0.280995708070957 3.925111519787034e-06 0.0007300707426803883 ENSG00000102760_at ENSG00000102760 RGCC 9.62248 0.15341397107173793 6 8.39046 0.3532896517023954 6 -1.2320200000000003 0.42572095208801153 0.00011917407973752977 0.005885259495875453 ENSG00000105426_at ENSG00000105426 PTPRS 6.452988333333334 0.14281736258826042 6 5.274061666666667 0.3113324096470952 6 -1.1789266666666665 0.44167997611368726 6.4321016538491e-05 0.004001542039681926 ENSG00000105509_at ENSG00000105509 HAS1 6.473198333333333 0.3178959606800103 6 5.311506666666666 0.35963050825349424 6 -1.161691666666667 0.4469881014379121 0.00015438606914079374 0.006719281183843587 ENSG00000108179_at ENSG00000108179 PPIF 10.561038333333334 0.25489116056989225 6 9.309206666666666 0.28445522274457646 6 -1.2518316666666678 0.4199147391712369 1.2276579724549462e-05 0.0014968028925405232 ENSG00000108932_at ENSG00000108932 SLC16A6 8.558381666666667 0.3322049753641064 6 7.4802800000000005 0.28312067942840213 6 -1.078101666666667 0.4736516559086895 0.00013692622441408407 0.006231261982975407 ENSG00000113070_at ENSG00000113070 HBEGF 8.716591666666668 0.5673187925114649 6 6.773975 0.4455397594715876 6 -1.9426166666666678 0.2601441794266279 7.884474159378447e-05 0.004544740634914615 ENSG00000122861_at ENSG00000122861 PLAU 7.451836666666668 0.5918918990378788 6 5.961998333333334 0.3770483329450837 6 -1.489838333333334 0.35605244547155324 0.0006816615774506012 0.017181108127197052 ENSG00000123689_at ENSG00000123689 G0S2 9.939016666666667 0.3075037023300156 6 8.505313333333332 0.5696477624520844 6 -1.4337033333333356 0.37017943802801023 0.0007180809407999025 0.017713590061435736 ENSG00000124875_at ENSG00000124875 CXCL6 3.9139649999999997 0.452448881786661 6 2.7617266666666667 0.3633948183266606 6 -1.152238333333333 0.4499266308424049 0.000750166358075774 0.018205197161502137 ENSG00000124882_at ENSG00000124882 EREG 11.248186666666667 0.4818967235691342 6 9.872838333333334 0.41576361232876907 6 -1.3753483333333332 0.38545962732720346 0.00037675653335544695 0.01162289344184443 ENSG00000125810_at ENSG00000125810 CD93 10.454553333333333 0.34477758335870173 6 8.706725 0.7212621469826351 6 -1.7478283333333327 0.29774963954226374 0.0009775288136345398 0.02155578628433898 ENSG00000129450_at ENSG00000129450 SIGLEC9 8.283306666666666 0.2892783453815144 6 7.034548333333333 0.4191001765886847 6 -1.248758333333333 0.42081022539924073 0.0002117202173501262 0.008029470236934049 ENSG00000130956_at ENSG00000130956 HABP4 7.0272749999999995 0.2872023248339052 6 6.010606666666667 0.12692371751042714 6 -1.0166683333333326 0.49425643918868967 0.00010547785204836596 0.0054945361399053975 ENSG00000139193_at ENSG00000139193 CD27 9.980375 0.4203939372897759 6 8.380303333333332 0.686226295755756 6 -1.6000716666666683 0.3298605912806088 0.001119290303050662 0.023610724753590207 ENSG00000139641_at ENSG00000139641 ESYT1 8.466143333333333 0.12506378399307536 6 7.385683333333333 0.3232594128353677 6 -1.0804600000000004 0.4728780232514007 0.00018301641490849052 0.007546317612780187 ENSG00000142512_at ENSG00000142512 SIGLEC10 7.253763333333333 0.6115448479929061 6 6.005815000000001 0.31907886872997393 6 -1.2479483333333317 0.4210465553078959 0.0025386821980342565 0.040255569241013645 ENSG00000143110_at ENSG00000143110 C1orf162 8.939996666666666 0.5194296193197563 6 7.846966666666666 0.2542416985206532 6 -1.0930299999999997 0.46877580020847626 0.0021757410705041565 0.036692411620507556 ENSG00000150540_at ENSG00000150540 HNMT 7.098486666666667 0.43687669105442856 6 5.744858333333333 0.2033864348885309 6 -1.3536283333333339 0.39130668619619763 0.0002250277587572564 0.008255962829590006 ENSG00000151715_at ENSG00000151715 TMEM45B 8.201695 0.6138047497290976 6 6.3307199999999995 0.22766480896264996 6 -1.8709750000000014 0.2733886017935743 0.00032934003634944035 0.010650054322660456 ENSG00000152784_at ENSG00000152784 PRDM8 8.240443333333333 0.5212058825710499 6 7.034763333333333 0.44420747245703407 6 -1.20568 0.433564938873574 0.0016213226180686912 0.030199963751566528 ENSG00000163734_at ENSG00000163734 CXCL3 7.789683333333333 0.5385984081917311 6 6.0001549999999995 0.409185924819024 6 -1.7895283333333332 0.2892666017274234 9.696161350097329e-05 0.0051924051461778725 ENSG00000163739_at ENSG00000163739 CXCL1 8.581226666666668 0.42905128237387496 6 7.131828333333334 0.6741615402087742 6 -1.4493983333333338 0.3661741026963958 0.0018718611369250657 0.03312414270216981 ENSG00000164683_at ENSG00000164683 HEY1 5.280346666666667 0.2856062272196926 6 3.7827516666666665 0.3808460079043322 6 -1.497595000000001 0.3541432623291184 2.5189182741759617e-05 0.0022473426798140825 ENSG00000167261_at ENSG00000167261 DPEP2 7.556281666666667 0.33006071025898664 6 6.188375000000001 0.4264658862206918 6 -1.3679066666666664 0.3874530304531984 0.00012950135127545522 0.006080848826816257 ENSG00000167895_at ENSG00000167895 TMC8 8.72867 0.23027469352927202 6 7.611105000000001 0.3775583520861376 6 -1.1175649999999981 0.4608710335357188 0.00022904171376410834 0.008361663252345284 ENSG00000168758_at ENSG00000168758 SEMA4C 7.036683333333333 0.21778509743934896 6 5.730746666666666 0.18657048133792958 6 -1.3059366666666676 0.4044584292417414 7.097425494556821e-07 0.0003252001162772005 ENSG00000169902_at ENSG00000169902 TPST1 6.7596300000000005 0.43190997923178387 6 5.6368 0.5433914413385621 6 -1.1228300000000004 0.4591921868834685 0.002950074231237789 0.04433657866667818 ENSG00000170873_at ENSG00000170873 MTSS1 7.993353333333332 0.2844905274111366 6 6.974381666666667 0.06145652525701952 6 -1.0189716666666655 0.49346796414905203 0.00022622584230564893 0.008282596140276646 ENSG00000171033_at ENSG00000171033 PKIA 6.324291666666666 0.4823110410271226 6 5.272968333333334 0.35197870335670384 6 -1.0513233333333325 0.48252535789711964 0.0018801019272326543 0.03322382615100035 ENSG00000171105_at ENSG00000171105 INSR 5.638843333333334 0.20705175069693724 6 4.626045 0.08431979192336776 6 -1.0127983333333335 0.4955840518492702 1.6188240274546216e-05 0.0017332299944369189 ENSG00000172594_at ENSG00000172594 SMPDL3A 8.611566666666667 0.4409349933795989 6 7.494978333333333 0.2629988624626857 6 -1.1165883333333335 0.4611831367567974 0.0006607500747854156 0.01695424007001872 ENSG00000173597_at ENSG00000173597 SULT1B1 6.918748333333333 0.5058893010695785 6 5.595814999999999 0.36685033633622305 6 -1.3229333333333342 0.3997213857995757 0.000551202220626771 0.015021076299668803 ENSG00000175463_at ENSG00000175463 TBC1D10C 8.336239999999998 0.20161747255632437 6 7.305283333333333 0.3292404354065076 6 -1.0309566666666656 0.4893855243464736 0.0001540130590082705 0.006719281183843587 ENSG00000175489_at ENSG00000175489 LRRC25 8.990631666666665 0.344393127539832 6 7.881208333333334 0.26301855876851493 6 -1.1094233333333312 0.4634792534760815 0.00012372121699263098 0.005999725882594448 ENSG00000175857_at ENSG00000175857 GAPT 8.538066666666666 0.4490964033998343 6 7.325314999999999 0.43693538912521135 6 -1.2127516666666667 0.43144493116466703 0.0007925256906748461 0.01887396228951068 ENSG00000178726_at ENSG00000178726 THBD 8.440775 0.9142337702524449 6 6.0962233333333335 0.20124522152505075 6 -2.344551666666667 0.1968881697980735 0.0011982561841221752 0.024604322388236316 ENSG00000179094_at ENSG00000179094 PER1 7.853758333333334 0.20373810752205077 6 6.833591666666667 0.3757956586985363 6 -1.0201666666666673 0.493059388502223 0.0004430807190181253 0.012980334292564287 ENSG00000182022_at ENSG00000182022 CHST15 9.235848333333335 0.31516275664593796 6 8.205561666666666 0.14415266982150102 6 -1.0302866666666688 0.4896128519804352 0.00016481160390683302 0.007011234208270316 ENSG00000183019_at ENSG00000183019 MCEMP1 6.256381666666666 0.4689189780512903 6 4.87939 0.3423180977395146 6 -1.3769916666666662 0.38502081107902664 0.00024056822098021512 0.00869415965416208 ENSG00000185112_at ENSG00000185112 FAM43A 7.973273333333332 0.434202956446253 6 6.841316666666667 0.5141118983126796 6 -1.1319566666666656 0.45629644955845544 0.0022008945054351452 0.037012063755490564 ENSG00000186049_at ENSG00000186049 KRT73 5.592216666666666 0.5816708556448972 6 3.6748766666666666 0.5010421693097964 6 -1.9173399999999998 0.2647421845168695 0.0001238464725784742 0.005999725882594448 ENSG00000186431_at ENSG00000186431 FCAR 10.082089999999999 0.5105884423290445 6 8.781296666666668 0.4219261471711213 6 -1.3007933333333312 0.40590293208854755 0.000786237858429987 0.01881212498451918 ENSG00000189057_at ENSG00000189057 FAM111B 6.675109999999999 0.5053699301303949 6 5.284108333333333 0.6150737745154372 6 -1.391001666666666 0.3812999728188149 0.001752526713738256 0.031762365376584806 ENSG00000196878_at ENSG00000196878 LAMB3 6.078693333333334 0.3267186012253769 6 5.048105 0.2624328468580105 6 -1.030588333333334 0.48951048492993166 0.00015417289690331431 0.006719281183843587 ENSG00000205336_at ENSG00000205336 ADGRG1 8.260435 0.3599834823293981 6 7.260278333333333 0.4064643761717216 6 -1.0001566666666664 0.4999457064188626 0.0011636244537057262 0.024165834009233344 ENSG00000213030_at ENSG00000213030 CGB8 9.953266666666666 0.6334849481926672 6 7.89762 0.7542940443885264 6 -2.055646666666666 0.2405407677741684 0.0005002935929712895 0.014149257864699668 ENSG00000226423_at ENSG00000226423 AC093642.1 8.741776666666667 0.5105983891344218 6 6.730626666666667 0.45085777773779917 6 -2.0111499999999998 0.2480752994263827 3.055229392220736e-05 0.002501319164248942 ENSG00000230747_at ENSG00000230747 AC021188.1 7.01167 0.44534974045125475 6 5.7048266666666665 0.4862367905318009 6 -1.3068433333333331 0.40420432580350185 0.0006813734027449039 0.017181108127197052 ENSG00000236453_at ENSG00000236453 AC003092.1 5.7514 0.7343631047377038 6 4.052880000000001 0.8006905830593989 6 -1.6985199999999994 0.3081020101294726 0.003367188713152956 0.0482308616012162 ENSG00000245954_at ENSG00000245954 LINC02273 5.7977533333333335 0.18209016389323923 6 4.617173333333334 0.09071658716390678 6 -1.18058 0.4411740993101188 1.3201613294331854e-06 0.0004368876752807329 ENSG00000250739_at ENSG00000250739 LINC01262 4.349975000000001 0.4427652792959266 6 3.330561666666666 0.2782885865727638 6 -1.0194133333333344 0.49331691698613334 0.0012154215833344241 0.024777098229222236 ENSG00000250790_at ENSG00000250790 AC127070.2 5.282284999999999 0.23057354121841492 6 4.277296666666667 0.31447607925988047 6 -1.0049883333333316 0.4982741607998221 0.00012799240229630117 0.006072458357269853 ENSG00000256742_at ENSG00000256742 KDM2B-DT 6.70449 0.3159921424339535 6 5.351001666666666 0.4866232449613012 6 -1.3534883333333338 0.3913446606763791 0.00034541804032730324 0.010968543183594824 ENSG00000258227_at ENSG00000258227 CLEC5A 10.31305 0.48059934157258277 6 8.595663333333333 0.7556858579771537 6 -1.717386666666668 0.3040990750409861 0.001322968561464147 0.02621452945818771 ENSG00000262001_at ENSG00000262001 DLGAP1-AS2 7.223923333333333 0.10124455178757354 6 6.167715 0.17703824951122848 6 -1.0562083333333323 0.4808942784611735 1.4746501265949762e-06 0.0004426812413842438 ENSG00000262655_at ENSG00000262655 SPON1 8.036769999999999 0.22201476004986673 6 6.784746666666666 0.21199389422025025 6 -1.2520233333333328 0.41985895585595534 1.630457807538275e-06 0.0004618889851978801 ENSG00000263264_at ENSG00000263264 AC119396.1 6.914149999999999 0.27576100492999367 6 5.862181666666667 0.29926956700718277 6 -1.051968333333332 0.48230967870969355 8.803163705505572e-05 0.004887194281997668 ENSG00000268758_at ENSG00000268758 ADGRE4P 6.6481916666666665 0.2926138953239691 6 5.544225 0.3825160245401491 6 -1.1039666666666665 0.46523557795163384 0.00028436779513350244 0.00966168020745588 ENSG00000271109_at ENSG00000271109 AC008555.4 8.636456666666668 0.3874979244675599 6 7.096856666666667 0.5987965829450489 6 -1.539600000000001 0.3439808130471202 0.0005917503335928741 0.015674617464255317 ENSG00000273265_at ENSG00000273265 CNNM3-DT 5.615895000000001 0.48597534985840607 6 4.36648 0.2214703836633694 6 -1.2494150000000008 0.42061873020368173 0.0007158825104119918 0.017693616033286494